Вчені назвали тварин, які можуть переносити COVID-19
Американські вчені, застосувавши методи машинного навчання, побудували тривимірні моделі білкових взаємодій між вірусом SARS-CoV-2 та клітинами-господарями для більш ніж п'яти тисяч ссавців. Автори відібрали близько 500 видів, які можуть заразитися та переносити коронавірус та з якими регулярно контактують люди. До списку увійшли, крім кажанів і гризунів, багато диких тварин — об'єкти полювання, такі як плямистий олень або азіатський буйвол, що вирощуються і містяться в неволі, наприклад, норки, а також домашні кішки. Результати дослідження опубліковані у журналі Proceedings of the Royal Society B.
Вірус SARS-CoV-2 – зоонозний за своєю природою. Вчені визнають, що для запобігання нових хвиль пандемії COVID-19 та появи нових небезпечних штамів необхідно поставити під контроль усі можливі контакти між тваринами – потенційними переносниками коронавірусу – та людиною. Основна перешкода в цій роботі - мала кількість досліджень, що оцінюють ймовірність поширення вірусу в природному середовищі.
Для того, щоб заповнити цю прогалину, дослідники під керівництвом Барбари Хан (Barbara Han) з Інституту екосистемних досліджень Кері в Нью-Йорку об'єднали екологічні та біологічні характеристики видів з даними тривимірного моделювання білково-білкових взаємодій вірусу з ангіотензин-перетворюючим ферментом 2 (ACE2) - Ключовим рецептором, необхідним для проникнення вірусу в клітину. Цей рецептор зустрічається в клітинах більшості хребетних, проте досі було невідомо, у яких видів він вступає у взаємодію з рецептор-зв'язуючим доменом (RBD) вірусу шипа SARS-CoV-2, а у яких немає.
Метод машинного навчання, який застосували автори, дозволив спрогнозувати результат зв'язування SARS-CoV-2 з рецепторами ACE2 для 5400 видів ссавців — значно більше, ніж було можливо раніше. За результатами аналізу вчені відібрали близько 500 видів, які регулярно контактують із людиною, можуть заражатися самі та передавати людині вірус SARS-CoV-2, тобто можуть стати потенційним резервуаром інфекції.
Почитати ще:
